淤泥恶水，停蓄弗流，春夏之交，蒸为疠疫。

工部不仅派人在盛京周边赶建疠迁所，还积极清淤，治理沟渠，处理垃圾，防止疫情反复。

户部财政拨款，购买药材，制成防疫控疾药剂，免费发放百姓。

减免赋税，控制物价，开义仓，保证民众温饱，并为盛京城内无家可归的难民提供吃住。

礼部积极分配医药资源，劝谕富有人家施医舍药，设流动粥棚和流动药铺。

设立施药局，与户部相互配合，共同防疫。

刑部组织一干衙役巡街，但凡发现干扰抗疫之人，皆擒至大牢，不问缘由，先处二十鞭刑。事态严重者，判斩立决，并祸及三族。

吏部和兵部则遣调一众官员和兵力积极守卫盛京城。

城内百姓，家中但凡有人感染天花，患病者被带去隔离，未病者则居家隔离，一月内不得出门。