按商毅的计划，手下的行政班子将分为民政部和统战部二个大部门，分别管理民政和军政。民政部下面又分为六个分司：行政司，总管目前两县一城的所有民事事务；仲栽司，管理民事纠纷事务，维护地方治安；农田司，负责农业耕作，畜牧、农田水利建设、粮食收存事务；教育司，主管教育事务；财政司，主管财务；工建司，负责民用各项建筑、施工工程。这些部门有三个是原来就有了的：民政司，教育司，财政司。另外三个新增设的：仲栽司，农田司，工建司。

另外还设立审计司，负责财务审计监督；文书司，负责处理有关的公文来往，人事档案资料等事务。这两个司将受商毅直接领导。

而统战部以下分为四个部门，参议司，负责组织安排，监督检查士兵的训练，制定作战计划，核算战争成本；军情司，负责收集各种情报信息；军器司，负责各种军事器械制造；后勤司，负责军队的后勤物资供应安排。

这样一来，管理机构更加完善，部门分得更为细化，同时互相分工也更为目确，行政管理的效率也会大大提高。虽然还有一些不足之处，但在现阶段是完全足够的。