了以尹昌衡为首的四川军人实力派和同盟会、立宪派组成的联合政府———四川军政府。9日晚，尹昌衡借口‘赵尔丰正密书调兵入川，企图卷土重来’，下令兵围赵尔丰所在的原四川总督府。似乎有要将他缉拿问责之意。

除此之外，12月6日，援川滇军第一梯团抵达叙府，第二梯团抵达沪州，第一梯团长谢汝翼见叙州府已宣布独立，建立了军政府，便召集川南军政府全体职员和胡重义等14名民军领袖，以及叙城绅、商、学界人士开会，当众宣言：滇军是率师北伐，借道叙府，数日后便开拔，决不干涉地方事务。川南军政府职员及川南革命军首领胡重义、罗子舟等皆深信不疑，遂下令为其补给，却不想谢汝翼就此停驻在叙州府，不再北上！于此同时，抵达泸州的李鸿祥部妄图北上的意图却十分明显。12月7日深夜，李鸿祥潜部下黄毓成连夜行军，赶至自流井地区。当时川东军政府已经接管自流井，因其隶属自贡乃是四川产盐重地，下令留有一营约四百余人驻守。深夜，黄毓成部赶至自流井地区，口称“成都叠遭兵变，财产损失，不下千万，若井盐复不能保，全川财源绝矣”，命令鄂军让出自流井地区防务，自流井地区为张本尧督管，得了李汉亲自批示要他严守自贡地区的他立刻派人拒绝了“滇军”的无礼要求，并下令全军戒备。果不然，黄毓成外号“黄毛牛”，乃是一刚愎自用之人，得知入川鄂军不愿让出自流井之后，立下下令推来携带的两门小炮，炮击川东军政府编制，被张本尧指挥鄂中军队反击，调集数门火炮反击，依托着防势击杀数十人之后，俘虏近百人，其余一百多人趁夜色方才逃回泸州，入川滇军方才不敢再行北上。

这算是入川滇军、鄂军之间的第一次交锋了，收到这消息之后，何进学足了李汉的手段，下令重庆等地报纸大肆宣传，导致滇军未入繁华地区，名声却已经臭了起来，落下了‘强盗’的骂名！

除此之外，因为此时清帝尚未退位，清廷正以重兵侵犯潼关，意欲在西北取得军事上的胜利，牵制东南革命党的活动，于是，东南、西南各省形势紧张。贵州军政府致电川东军政府，表示愿意派兵，与川东军政府一道防范清军兵犯潼关，甚至组建北伐联军。四川省内革命党人也认为，“论川局则统一为先，论大局则北伐为急”。不过因为愤恨李汉派兵入川强夺革命果实的行为，却根本不与他联系，甚至绕开了川东军政府跟他，直接急电孙中山等，谓之曰“若西北各省为虏所得，则南北对峙之局势危”，请求联合各省军队，共谋北伐。1911年12月9日，四川同盟会负责人杨沧白、张培爵等更是亲自赶赴川南，同入川的滇军协商，议决北伐。因为前段时间鄂军、滇军之间在自流井发生的一些矛盾，滇军拒绝将川东军政府纳入北伐军之中，后来不知怎么的又说服了贵州军政府大都督，令他绝口不提川东军政府，改为推选四川同盟会成员张培爵为“组织川滇黔三省会师北伐代表官”，以副都督夏之时、川北镇守使李秀昂分别为“北伐团总司令官”、“北伐第一军总统官”，趁机提出了北伐计划。并将这一计划电告湖北、陕西、云南、贵州、湖南都督，希望各省能“取消和议，锐意进取”。

虽说南北和谈在即，不过深懂政治的孙文先生也在上海主动出面表态支持四川同盟会的北伐之举，不过他对联军将兵多将广的荆楚镇守使李汉排挤在外的行为略有些不满，不过在询问过四川同盟会遭到四川同盟会成员的断然拒绝之后，绝口不再提令李汉加入北伐联军之中的事情。

不仅如此，很快，四川同盟会又发电湖北，道“鉴于鄂军入川之后占去了重庆等地区，导致川内民军军械缺乏，不能追剿清军”，恳请湖北军政府接济，并下令命荆楚镇守使李汉调回入川鄂军，由川人自己管理四川事务。

四川最近的乱局还不仅只有这些呢，当时，川汉铁路已经停修，股款保存在重庆驻沪商代表童子钧、陈少谷手中，四川同盟会员准备利用此款筹组“蜀军”，认识到武力重要性的四川同盟会希望能够通过组建‘蜀军’，迫使入川强夺革命果实的鄂军离开，并作北伐之师。