但屯齐的态度还算不错，至少也算是一个好的开始，因此也各回各自的衙门，招集各衙门其他官员也在报道聚集，大家一起清点人员文件、府库的物资，只等着阿济格的招见。同时又命清军把六部九寺十三衙门全都看守起来。

但打从众官员开始忙碌起，南京城中的枪炮爆炸声音就一直响个不停，显然是商家军还在与清军激战。而众官员的表情也不尽相同，有人面带冷笑，不时还说几句什么不自量力、螳臂当车之类的话；也有人面带羞愧，不住的哀声叹气；还有人面无表情，对外界的反应一概无视，装没听见。

只有户部郎中刘成治听说众臣齐降的消息，慨然道：“国家养士三百年，难道就无一忠义之人以报朝廷？”然后持笔题壁：“钟山之气，赫赫洋洋；归于帝侧，保此冠裳。”掷笔于地，然后自缢殉国。

在南京之战开始之前，被罢职的东林众人中，黄宗羲、黄震周、方以智、陈贞慧、冒避疆等年轻一些的人员都先后离开南京，但候恂、钱谦益等老官僚不甘心就此沉寂下去，还留在南京等待时机。

不过因为候、钱二人名望颇大，赵之龙等人降清之后，立刻被人来招他们两人，一同投降。

钱谦益得知南京城破之后，也一度长吁短叹，大哭不止，爱妾柳如是曾劝他自杀殉国，以死全节，表示忠贞之心。钱谦益思索再三，终于点头同意，决定共投莲花池，那知老钱刚刚步入湖中，水湿鞋袜，立刻就缩了回来，道：“湖水太冷，不好死，等等再说……”到是柳如是反而愤然欲投湖自尽，却被钱谦益死死拉住，结果总算是两口子谁也没死戌。

不过赵之龙使人来招钱谦益投降，老钱立刻整衣出府，加入投降队伍。临走前还命家人看好柳如是，不要让她再寻短见了。另一边侯恂也带着儿子侯方域，应诏投降。

一直等到下午三时许，才有人到各部通知，命明朝的众官员去朝见阿济格。可怜众官员也都熬了一夜未眠，这时在各自的衙门是清理文件府库，有些人实在敖不住了，只能趴在桌子上打一个盹儿。听到阿济格要招见他们，谁敢不听，因此也都睡眼惺忪，赶进了皇宫。

阿济格也是在太和殿招见明朝的降官，当然现在的太和殿己经清扫了一净，而不少明朝降官心里也都生出了一夜之间，物似人非之感，昨天晚上在这里还是明朝的皇城，自己还和朱由崧一起庆贺除夕，而今天坐在这里的，却是清廷的亲王，而自已却都变成了阶下降臣。

前来朝见阿济格的，有勋臣忻城伯赵之龙、保国公朱国弼、隆平侯张拱日、临淮侯李祖述、怀宁侯孙维城、灵璧侯汤国祚、安远侯柳祚昌、永康侯徐洪爵、定远侯邓文郁、项城伯常应俊、大兴伯邹存义、宁晋伯刘允极、南和伯方一元、东宁伯焦梦熊、洛中伯黄九鼎、成安伯郭祚永、驸马齐赞元等十七名勋爵，而文臣包括大学士王铎以外，还有大学士蔡奕琛、侍郎朱之臣、梁云构、都御史李乔，罢职的钱谦益、候恂，以及各翰、詹、科、道、部、寺五品以上的官员，还有两各太监头领王德化和卢九德带领着一干太监人负，一共有三百多人。在太和殿上，黑压压的站了一大片。

阿济格虽然脾气暴燥，但并不是不通事理的人，现在商家军依然在南京城中顽强抵抗，清军想到完全占领南京，还不知要等到什么时候，因此对这批投降的官员还是要好好安抚，以瓦解商家军的斗志，以示清军的宽宏大量。同时也是消除江南其他各地对清军的反抗情绪。

于是阿济格也首先对众人说了几句安慰的话，表示只要是诚心投降大清，那么以前的事情一概过往不咎，并且保证众人及其家属的安全。不过要是怀有二心，假意投降，还想着复兴明室，图谋反叛后，或者是明知有人图谋不诡，依然隐情不报，甚至包庇隐瞒者，不仗一概杀无赦，而且还是满门抄决、诛连九族。

众官员也被吓得一怔一怔，听完之后，赶忙跪伏于地，一边口称大清万岁，一边纷纷表明心迹，说明自已是真心投降，决不会反复无常，同时赵之龙还表示，愿意为大清统一天下，效犬马之劳，帮助阿济格